2013年
2013年7月，恒康生物联合创始人扬子江药业集团董事长徐浩宇先生、上海金儒文化发展有限公司董事长王晋成先生赴日本热带资源研究所、日本EM研究所进行考察交流。
2014年
2014年12月30日，恒康生物依托中国医药城、中国疫苗工程中心宣布成立，决心打造大健康产业中的民族品牌。成立伊始就确定了“立足生物、传播健康，立足科技、造福人类”的发展愿景。
2015年
2015年1月，恒康生物与日本EM研究所达成合作关系，聘请前所长新川善和先生担任首席科学家。
2015年2月，首席科学家新川善和先生带领研发团队全面展开益生菌菌种研究。
2015年5月，启动首席科学家新川善和先生独创的ZW复合益生菌菌群发酵工艺以及植物发酵饮品研究。
2016年
2016年6月，恒康生物坐落于国家级高科技园区中国医药城的新厂房投入使用。新厂房拥有标准化的生产车间、现代化的研发实验室，徐浩宇董事长警示：质量是企业品牌的灵魂！
2016年9月，原泰州市委曲福田书记、陆春云书记莅临恒康生物新厂房参观指导。
2017年
2017年3月15日，恒康生物成立了拥有自主知识产权的益生菌资源库：“恒康微生物菌种保藏管理中心（Hengkang Center of Microbiological Culture Cellection，HKMCC）”。
2017年9月，恒康生物百益纯®发酵大麦芽饮品、生命之露®植物发酵饮品隆重上市。
2017年11月1日，英国伯明翰区长皮特.瑞森先生一行来到恒康生物参观考察。皮特.瑞森先生对恒康生物ZW发酵模式、EM生态农业及微生态环保给予了高度的肯定，希望促成恒康生物与伯明翰地区生物企业合作。
2018年
2018年，恒康生物和日本立命馆大学、美国纽约大学、南京中医药大学、江苏省肿瘤医院、军事医学科学院、中科院微生物所、北京博瑞世安科技有限公司等展开关于生命之露®植物发酵饮品调节免疫功能、抗疲劳、辅助抑制肿瘤细胞等功能研究。
2018年1月1日，中国医药企业协会指定恒康生物益生菌产品为伴手礼。
2018年1月1日，恒康生物入驻全球500领袖国医健康俱乐部。
2018年9月18日，恒康生物携新品百益纯®晶球益生菌亮相第九届国际医药博览会，受到广泛关注。
2018年12月14日，徐浩宇董事长被评为“十大创新创业高层次人才”。
2019年
2019年1月18日，恒康生物产品成功入驻天猫、京东商城，线上销售正式启动。
2019年3月1日，恒康生物聘请军事医学科学院杨瑞馥教授、中国科学院微生物研究所朱宝利教授、中国医药企业家协会郭云沛会长作为科学顾问。
2019年 4月11日，恒康生物完成收购赫柔（上海）实业有限公司。
2019年5月6日，恒康生物董事长徐浩宇先生受邀参加中国肠道大会，并进行了《从制药人到健康传播者》的演讲。
2019年6月11日，恒康生物通过HACCP、ISO9001、ISO22000质量体系认证。
2019年8月3日，恒康生物生命之露®植物发酵饮品抗疲劳和抑制肿瘤作用研究在第四届食品科学与人类健康国际研讨会发布，受到现场专家的热切关注讨论。
2019年8月22日，恒康生物百益纯®晶球益生菌入驻上海第一医药股份有限公司2000余家药房；同时，百益纯®晶球益生菌广告于上海第一财经（CBN）黄金档播出。
2019年10月25日，恒康生物通过了《企业知识产权管理规范》国标GB/T29490-2013的认证，并收到由中规（北京）认证有限公司颁发的《知识产权管理体系认证证书》，这标志着恒康生物知识产权工作体系的建立。目前为止，恒康生物围绕产品、菌株、工艺等。已申报专利30余项，授权10余项。
2019年11月5日，恒康生物荣获“江苏省民营科技企业”称号。
2019年11月8日，恒康生物百益纯®晶球益生菌产品成功中标温州医科大学附属第二医院营养食品科目。
2020年
2019年1月9日，我司与南京师范大学泰州学院共同举行了产学研合作授牌仪式。产学研签约仪式的确定，标志着南师大泰州学院与我司正式达成校企联合。进一步合作。
2020年9月，恒康生物通过HACCP、ISO9001、ISO22000质量体系认证。